Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PMCHL1Q16048 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PMCHL1Q16048 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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