Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 OAZ3-201ENST00000321531 851 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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ZFHX3Q15911 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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ZFHX3Q15911 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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ZFHX3Q15911 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 SUGT1-202ENST00000343788 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 CD8B-202ENST00000349455 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
ZFHX3Q15911 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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