Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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NCOA1Q15788 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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NCOA1Q15788 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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NCOA1Q15788 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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NCOA1Q15788 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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NCOA1Q15788 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NCOA1Q15788 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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