Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1SQ13698 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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