Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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HTR4Q13639 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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HTR4Q13639 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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HTR4Q13639 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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HTR4Q13639 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HTR4Q13639 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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