Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TCIRG1Q13488 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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TCIRG1Q13488 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TCIRG1Q13488 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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