Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LSAMPQ13449 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LSAMPQ13449 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LSAMPQ13449 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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LSAMPQ13449 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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