Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SCGB2A2Q13296 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms