Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CLN3Q13286 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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