Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF5Q13243 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms