Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DUSP4Q13115 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DUSP4Q13115 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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