Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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CHAF1AQ13111 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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CHAF1AQ13111 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHAF1AQ13111 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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