Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 FUNDC1-201ENST00000378045 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM2Q13029 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
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