Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SREBF2Q12772 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SREBF2Q12772 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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