Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNEQ04844 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms