Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMAD3P84022 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms