Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CBX1P83916 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 ZIK1-202ENST00000536878 4144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CBX1P83916 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CBX1P83916 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CBX1P83916 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CBX1P83916 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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CBX1P83916 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CBX1P83916 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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CBX1P83916 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 FAS-204ENST00000355740 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CBX1P83916 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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