Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COG7P83436 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
COG7P83436 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COG7P83436 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms