Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CACNA2D1P54289 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms