Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPD2P43304 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPD2P43304 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPD2P43304 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPD2P43304 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPD2P43304 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPD2P43304 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPD2P43304 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPD2P43304 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPD2P43304 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPD2P43304 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPD2P43304 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPD2P43304 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GPD2P43304 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPD2P43304 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPD2P43304 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPD2P43304 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPD2P43304 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GPD2P43304 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GPD2P43304 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GPD2P43304 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms