Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CASQ1P31415 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
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CASQ1P31415 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CASQ1P31415 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CASQ1P31415 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CASQ1P31415 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CASQ1P31415 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CASQ1P31415 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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