Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RARGP13631 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RARGP13631 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RARGP13631 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms