Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms