Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN11O75508 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN11O75508 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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