Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSCO60682 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSCO60682 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSCO60682 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSCO60682 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSCO60682 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSCO60682 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSCO60682 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSCO60682 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSCO60682 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MSCO60682 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSCO60682 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSCO60682 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSCO60682 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MSCO60682 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MSCO60682 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MSCO60682 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MSCO60682 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms