Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E2F8A0AVK6 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms