Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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ARL2-SNX15V9GYD0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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ARL2-SNX15V9GYD0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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ARL2-SNX15V9GYD0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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ARL2-SNX15V9GYD0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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ARL2-SNX15V9GYD0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ARL2-SNX15V9GYD0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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