Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPC6Q9Y625 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPC6Q9Y625 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms