Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K3

PCYT1B, Choline-phosphate cytidylyltransferase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1BQ9Y5K3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCYT1BQ9Y5K3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCYT1BQ9Y5K3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCYT1BQ9Y5K3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms