Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K1

SPO11, Meiotic recombination protein SPO11, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPO11Q9Y5K1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPO11Q9Y5K1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms