Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AFG3L2Q9Y4W6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
AFG3L2Q9Y4W6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFG3L2Q9Y4W6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms