Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R0

GRIP1, Glutamate receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP1Q9Y3R0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRIP1Q9Y3R0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIP1Q9Y3R0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms