Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
REXO2Q9Y3B8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
REXO2Q9Y3B8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms