Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B2

EXOSC1, Exosome complex component CSL4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC1Q9Y3B2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EXOSC1Q9Y3B2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC1Q9Y3B2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms