Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK3Q9Y2K2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms