Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ITM2BQ9Y287 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITM2BQ9Y287 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms