Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOD1Q9Y239 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NOD1Q9Y239 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOD1Q9Y239 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms