Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GNEQ9Y223 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNEQ9Y223 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms