Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDZRN3Q9UPQ7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDZRN3Q9UPQ7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms