Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCML1Q9UN30 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCML1Q9UN30 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms