Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLEC4EQ9ULY5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLEC4EQ9ULY5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLEC4EQ9ULY5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms