Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZMYND8Q9ULU4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZMYND8Q9ULU4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms