Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNOT6Q9ULM6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNOT6Q9ULM6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms