Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GRID1Q9ULK0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GRID1Q9ULK0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRID1Q9ULK0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms