Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG6

CCPG1, Cell cycle progression protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCPG1Q9ULG6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCPG1Q9ULG6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCPG1Q9ULG6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCPG1Q9ULG6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCPG1Q9ULG6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCPG1Q9ULG6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCPG1Q9ULG6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCPG1Q9ULG6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCPG1Q9ULG6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCPG1Q9ULG6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCPG1Q9ULG6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCPG1Q9ULG6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCPG1Q9ULG6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCPG1Q9ULG6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCPG1Q9ULG6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCPG1Q9ULG6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms