Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MKLN1Q9UL63 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKLN1Q9UL63 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms