Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3Q9UKS6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3Q9UKS6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms