Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCL2Q9UBD3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
XCL2Q9UBD3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms