Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SPRR3Q9UBC9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPRR3Q9UBC9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms