Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B7

CFAP97, Cilia- and flagella-associated protein 97, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP97Q9P2B7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CFAP97Q9P2B7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP97Q9P2B7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms